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ゲノムデータ解析ソフトウェア NVIDIA Parabricks 提供のお知らせ
2020 年 5 月 20 日
ヒトゲノム解析センター スーパーコンピュータ SHIROKANE 利用者各位
日頃から当センターのサービスをご利用いただきありがとうございます。
SHIROKANE の一部の計算ノードにて GPU による高速な全ゲノム一次解析が可能なNVIDIA Parabricks パイプラインが利用できるようになりました。 Tesla V100 を搭載している計算ノードをご利用になれる利用者は、 Parabricks についての追加の課金なしに、 Parabricks をご利用になれます。
Parabricks の SHIROKANE での利用事例では、従来の 5 倍の解析速度を得ました。
詳しくは次のプレスリリースをご覧ください。
Parabricks は GPU 計算ノードのうち Tesla V100 を搭載しているノードにて実行するため、ご利用コースに GPU V100 がある場合に使用できます。 GPU V100 は、オプション追加により増やすことができます。 SHIROKANE の Parabricks は GPU V100 が 8 個の時に最高性能になります。
ご不明点等ございましたら、SHIROKANE Q&A などにてお問い合わせください。
